Tỉnh Quảng Trị là đầu mối giao thông qua lại giữa hai miền Nam Bắc và có biên giới giáp nước bạn Lào nên diễn biến dịch bệnh hết sức phức tạp; chỉ đạo phòng chống dịch bệnh luôn được Lãnh đạo tỉnh quan tâm đúng mức, trên cơ sở đó ngày 16/11/2009 Chủ tịch UBND tỉnh Quảng Trị đã có Chỉ thị số 13/CT-UBND chỉ đạo các cơ quan, ban ngành trong tỉnhtăng cường phòng chống dịch bệnh mùa đông xuân.
Kiểm soát bệnh nhân sốt rét ở các vùng có dân di biến động như đi rừng, ngủ rẫy, di cư tự do và đặc biệt là giao lưu biên giới đang là vấn đề khó khăn trong chương trình phòng chống sốt rét hiện nay. Hiệu quả kết hợp quân dân y trong phòng chống sốt rét ở biên giới Việt-Lào thuộc tỉnh Quảng Trị là một trong những bài học kinh nghiệm quý trong quản lý sốt rét ở các vùng có dân di biến động này
Theo thông báo của Tổ chức Y tế thế giới (WHO) tình hình một số bệnh truyền nhiễm gây dịch có xu hướng gia tăng và diễn biến phức tạp. Từ đầu năm 2007 đến nay, thế giới ghi nhận 18 trường hợp mắc cúm A (H5N1 ),