Hàng năm các chương trình mục tiêu y tế quốc gia cung cấp một số lượng lớn vật tư, kinh phí để sử dụng cho công tác bảo vệ sức khỏe cộng đồng; trong đó có vật tư, kinh phí phòng chống sốt rét và phòng chống giun sán
Phú Yên là một trong những tỉnh duyên hải miền Trung có tìnhhình sốt rét tương đối ổn định từ nhiều năm nay, tuy nhiên nguy cơ sốt rét còn cao đặc biệt là ở các huyện miền núi Đồng Xuân, Sơn Hòa và Sông Hinh.
Bệnh sán lá gan nhỏđã được phát hiện ở 7 tỉnh trong khu vực miền Trung-Tây Nguyên bao gồm: Phú Yên, Bình Định, Quảng Ngãi, Quảng Nam, Kon Tum , Đak Lak, Đak Nong;
Tỉnh Phú Yên thuộc Nam Trung bộ, có 8 huyện thị, 104 xã, 574 thôn với dân số 863.692 người; trong đó có 65 xã, 383 thôn với 423.889 người sống ở vùng sốt rét lưu hành.