Đoàn TNCS Hồ Chí Minh phát triển với sự đi lên của Viện được Đảng ủy, ban lãnh đạo quan tâm lãnh đạo và chỉ đạo. Với đặc thù công việc Đoàn Thanh niên luôn chú trọng tới việc giáo dục chính trị, tư tưởng, giáo dục y đức theo lời dạy của Bác “Lương y như từ mẫu” tuổi trẻ của viện luôn phấn đấu “Học tập và làm theo tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh”.

Dịch vụ khám chữa bệnh chuyên ngành của Viện Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng Quy Nhơn thuộc Bộ Y tế về các bệnh ký sinh trùng và các bệnh do véc tơ truyền, đặc biệt là các bệnh ký sinh trùng mới nổi như sán lá gan lớn, sán lá gan nhỏ, giun lươn, giun đũa chó và các bệnh thông thường khác;

Trung tâm Dịch vụ khoa học kỹ thuật của Viện Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng Quy Nhơn thuộc Bộ Y tế chuyên sản xuất mua bán hóa chất, vật tư, chế phẩm diệt côn trùng; dịch vụ diệt côn trùng gây bệnh, côn trùng gia dụng như muỗi, ruồi, gián, kiến…; dịch vụ phòng diệt mối mọt và xét nghiệm phát hiện tôm bằng các kỹ thuật hiện đại.

Phạm vi hoạt động của Viện bao gồm 15 tỉnh thuộc khu vực miền Trung-Tây Nguyên: 11 tỉnh ven biển miền Trung (từ Quảng Bình đến Bình Thuận) và 4 tỉnh Tây Nguyên (Gia Lai, Kon Tum, Đăk Lăk, Đăk Nông); có đặc điểm địa hình phức tạp và thời tiết khắc nghiệt, phải chịu ảnh hưởng trực tiếp của biến đổi khí hậu toàn cầu và gánh chịu hậu quả của hầu hết các cơn bão hàng năm;

Viện Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng Quy Nhơn là đơn vị sự nghiệp thuộc Bộ Y tế, có tiền thân từ Trạm nghiên cứu sốt rét Trung Trung bộ (1968), Phân viện Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng Quy Nhơn (1977), Viện Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng Quy Nhơn (1998).

Viện có 13 khoa, phòng và đơn vị trực thuộc (6 khoa chuyên môn, 5 phòng chức năng và 2 đơn vị trực thuộc); Đảng bộ Viện có 5 chi bộ trực thuộc và 53 đảng viên; Công đoàn Viện có 138 đoàn viên và 14 tổ công đoàn trực thuộc; Đoàn TNCS Hồ Chí Minh có 5 chi đoàn trực thuộc (1 chi đoàn cán bộ và 4 chi đoàn học sinh trung cấp kỹ thuật viên xét nghiệm) và 216 đoàn viên; Hội đồng Y đức, Hội đồng Khoa học công nghệ.

Viện Sốt rét - Ký sinh trùng -Côn trùng Quy Nhơn có chức năng nghiên cứu khoa học, chỉ đạo chuyên môn kỹ thuật và biện pháp phòng chống, đào tạo và đào tạo lại cho cán bộ chuyên ngành các bệnh sốt rét, ký sinh trùng và côn trùng truyền bệnh cho người trong phạm vi 15 tỉnh miền Trung-Tây Nguyên.

Ban Nữ công Viện Sốt rét KST - CT Quy Nhơn là tổ chức đoàn thể trực thuộc Ban chấp hành Công đoàn Viện Sốt rét KST-CT Qui Nhơn, dưới sự chỉ đạo của Đảng ủy Viện và Công đoàn nghành y tế Việt Nam. Trong thời gian qua phong trào thi đua "Giỏi việc nước -Đảm việc nhà" trong nữ cán bộ CNVC đơn vị luôn phát huy vai trò người phụ nữ gương mẫu trong công tác chuyên môn cũng như công tác xã hội & gia đình.